除了DNA,还有RNA,RNA是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。对于RNA的检查,目前有rna聚合酶链式反应技术,rna聚合酶链式反应相对比较准确,接下来我们来具体了解下rna聚合酶链式反应的相关知识吧。
rna聚合酶链式反应主要检查的是RNA,那么rna聚合酶链式反应是什么来的呢?
RNA的聚合酶链式反应:目前常用的RNA检测方法有原位杂交,点杂交,Northern印记杂交以及核酸酶保护试验等。这些方法的普遍缺点是难以检测低丰度的信使RNA,并且操作繁琐,将RNA反转录和PCR结合起来建立RNA聚合酶链式反应(RT-PCR)则可以克服上述缺点。
其实人体一个细胞含RNA约10pg(含DNA约7pg)。与DNA相比,RNA种类繁多,分子量较小,含量变化大。RNA可根据结构和功能的不同分为信使RNA和非编码RNA。非编码RNA分为非编码大RNA和非编码小RNA。非编码大RNA包括核糖体RNA、长链非编码RNA。非编码小RNA包括转移RNA、核酶、小分子RNA等。小分子RNA(20~300nt)包括 miRNA、 SiRNA、 piRNA、scRNA、 snRNA、 snoRNA等,细菌也有小分子RNA(50~500nt)。
RNA方面有rna聚合酶链式反应技术,那么rna聚合酶链式反应技术什么样呢?
rna聚合酶链式反应技术先在反转录酶的作用下以信使RNA为模板合成cDNA,再以CDNA为模板进行PCR反应。此法快速,简便,并且灵敏度高。rna聚合酶链式反应技术可以检测单个细胞中少于10个拷贝的特异RNA。
任何生物大分子都有结构的多样性和特异性。RNA的结构特异性主要体现在组成RNA的单体——核糖核苷酸的数目和排列顺序上。比如某段RNA含有100个核糖核苷酸,它的多样性可以达到4的100次方;但每一种RNA只有一种结构,这就是它的特异性。就像班里有50个学生,排位时第一个学生有50中选择,第二个学生有49个选择,以此类推,班里排位的方式可以多达50的阶乘,这就是多样性;但现实中班里的位次就是眼前这一种,这就体现了特异性。
RNA跟DNA的机制是不太一样的,其中rna聚合酶链式反应的原理是什么呢?
rna聚合酶链式反应的关键步骤是RNA的反转录,要求RNA模板必须是完整。并且不含DNA,蛋白质等杂质。若RNA模板中污染了微量DNA,扩增后会出现特异DNA的PCR产物。而cDNA扩增产物却很少,必要时可用无RNase的DNase处理反转录产物,消除DNA后在进行PCR。如果蛋白质未除尽可与RNA结合,从而影响反转录和PCR反应。
目前转移RNA(tRNA)在蛋白质合成过程中负责转运氨基酸、解读mRNA遗传密码。tRNA占细胞总RNA的10%~15%,绝大多数位于细胞质中。tRNA由Crick于1955年提出其存在,Zamecnik和 Hoagland于1957年鉴定。
rna聚合酶链式反应操作得当才准确,那么rna聚合酶链式反应操作过程是什么呢?
rna聚合酶链式反应定量方法包括PCR反应和转录反应二个步骤,二个步骤相互接续,可以只用一个试管来完成,先用PCR来扩增目标基因,但PCR循环数比通常少5-10个循环,虽然此时反应液中扩增产物的总量较少,不能直接用通常的核酸染色剂来定量测定,但因为PCR反应仍处在直线阶段未进入平坡期,所以扩增产物总量与样品中原始模板的数量成正比例。其在于用转录反应使PCR扩增产物进一步按线性增加的方式合成RNA。这一设想能付之实现的基础是发现PCR反应液的必要成份脱氧核糖核苷酸,正,反引物和DNA聚合酶等在相当宽的浓度范围内对转录反应没有可测见的显著影响。
所以,在完成PCR反应后可以不经过任何分离步骤而进入转录反应。在RNA聚合酶和核糖核苷酸底物过量,反应温度和时间固定的条件下,RNA的合成量与转录反应的模板数量,即PCR扩增产物的数量成正比例,所以,最终合成的RNA量反映了样品中原始模板DNA的数量。由转录反应合成的RNA量可达到模板数量的几百至千倍,从而可以方便地用溴乙锭或其他核酸染色剂定量测定。