这个免疫系统有辨别自身组织和异物的能力。但是，有些组织由于某种并障隔绝，不能被该系统识别。例如，精子与血液循环是隔绝的，从不与淋巴细胞相遇，因此不会发生免疫反应。如果生殖道发生了损伤或炎症，使精子与血液相遇，就会发生免疫反应。约有百分之五至百分之十不育男性的血液和精液中存在着精子凝集抗体和精子制动抗体，使精子发生凝集和不动，从而导致不孕。
从目前的数据资分析，约有20%的不孕夫妇属于原因不明的，随着生殖免疫学研究的进展，认为原因不明的不孕多数是由于免疫学的因素所引起。上海健桥医院专家说，要检查确诊免疫性不孕必须要遵循以下诊断要点：
