HSV是嗜神经病毒，经破损的皮肤黏膜进入角质形成细胞，在细胞内复制，导致细胞肿胀、变性、坏死，产生皮肤损害。感染细胞可与未感染细胞融合，形成多核巨细胞。
HSV也可不产生临床症状而沿感觉神经轴索迁移到骶神经节，形成潜伏感染。HSV感染后1周血中出现特异性IgM抗体，2周左右出现特异性IgG抗体，抗体可中和游离病毒，阻止病毒扩散，但抗体不能清除潜伏的病毒，也不能防止疱疹复发。
在机体免疫力降低或某些因素如日晒、月经、寒冷、发热、劳累等可激活潜伏的HSV，病毒沿感觉神经轴索下行到末梢而感染邻接的皮肤黏膜细胞并进行增殖，导致局部疱疹复发。
