检查基础性激素前至少一个月不能用性激素类药物(包括黄体酮、雌激素类)，否则结果会受到影响(治疗后需要复查性激素除外)。月经任何时间检查性激素都可以，每个时段的正常值不同。但是诊治不孕症一定要了解基础性激素水平，首先要选择月经第2-5天检查，称为基础性激素水平， 第3天测定最好。
确定是来月经第3天，检查性激素5项即可，可以不查孕酮，孕酮应该在黄体期检查(月经21天或排卵后7天);但不能肯定阴道流血是否月经，应该检查6项，以防止误诊(根据P数据可以大概判断月经周期时段)。
在进行性激素六项的检查之前最好是保持空腹，因为这样更能保证检查的准确性。
