现有的HPV疫苗不能涵盖所有致病的HPV亚型。所以，打了宫颈癌疫苗并不代表可以高枕无忧，疫苗接种不可以完全替代宫颈癌的筛查，而且接种后不应该改变筛查间隔以及开始筛查的时间。由于一旦有了性生活，就可能感染HPV，感染后再接种HPV疫苗就变得没有了意义，因此建议HPV疫苗在初次性生活以前接种。
HPV疫苗最有效果是在有性生活之前接种，有了性生活之后，经济条件允许的当然也可以选择接种，但是可能就无法产生预防效果，如果没有感染过疫苗所涵盖的亚型，则能产生保护，但此时疫苗的重要性已经远远不及做宫颈癌筛查。假如筛查出HPV阴性，也可以选择接种。
