剖宫产并不是最理想的分娩方式，它只是一种万不得已的分娩方式是用来解决难产、保全胎儿和孕妇的生命的一种应急措施，而不能盲目选择。
剖宫产母儿并发症
与正常阴道分娩相比，剖宫产并发症较多。对母亲来讲，手术过程中除麻醉风险，术中出血量多于自然分娩;手术后易发生感染;手术后活动受限制、不能很快恢复饮食，会引起乳汁减少，使哺乳时间推迟;腹部手术伤口愈合较阴道自然分娩慢的多。对宝宝来讲，阴道分娩，胎头娩出过程中经产道多次挤压，使胎儿的大脑及肺受到规律性渐进性的良性刺激，有利于新生儿的智力发育，同时肺内液体被挤压出来可明显减少新生儿肺炎湿肺的发生。而剖宫产分娩的孩子由于没有经过产道挤压过程，像湿肺等并发症比自然分娩高。
剖宫产对婴幼儿健康影响
新近研究发现剖腹产的婴儿肠道中双歧杆菌样细菌和乳酸杆菌样细菌定植的速度延迟，剖腹产的婴儿发生腹泻和对食物过敏原过敏的危险性较大于阴道分娩组。Negele K研究组结果提示，剖腹产可能是2岁以前发生喘鸣和至少对食物过敏原发生过敏的另外一个危险因素(Pediatr Allergy Immunol. 2004 15: 48-54 )。Salminen S等研究发现剖腹产的婴儿形成多样化菌群的速度比较缓慢，与顺产的婴儿有差别，甚至在出生6个月之后，也可能到7岁的时候仍与顺产的婴儿有差别(Gut. 2004 53: 1388-1389)。
这些研究提示了剖腹产的婴儿，肠道菌群的形成延迟，其结果可导致这些婴儿在相当长一段时间内可能存在免疫系统相对不足，而易发生过敏性疾病。如果剖腹产的婴儿不能母乳喂养，那么添加独特益生元组合的婴儿配方奶粉对他们会有非常大的价值。